Научно-практический семинар по обучению технологии «Nanostring»
Технология Nanostring является передовой технологией пространственной транскриптомики, которая позволяет напрямую измерить уровень транскриптомной активности генов и уровень трансляции соответствующих им белков, а также профилировать экспрессию микроРНК с последующей оценкой копийности генов. Данный метод заключается в маркировке мишеней уникальными флуоресцентными штрих-кодами, прикрепленными к мишень-специфичным зондам и их последующей детекции. Такая технология позволяет получать надежные данные обо всех образцах, включая ткани, фиксированные формалином и залитые парафином (FFPE).
Научно-практический семинар проходил с 28 февраля 2022 г. по 3 марта 2022 г. на базе лаборатории генетических технологий ЦНИЛ СибГМУ, г. Томск в рамках исследовательской программы "Развитие технологий геномного редактирования для решения инновационных задач биомедицины и диагностики".
Научно-практический семинар проводился с участием сотрудников компаний «БиоВитрум» и «NanoString technologies» и включал в себя два модуля:
28 февраля (лекции и семинары):
· Обзорная презентация по технологической платформе NanoString;
· Особенности анализаторов nCounter, GeoMx, CosMx и их применения;
· Примеры применения технологии GeoMx для клинических исследований в онкологии, исследование иммуноонкологических процессов и микроокружения опухоли;
· Практическое применение технологии CosMx.
Научно-практический семинар проходил с 28 февраля 2022 г. по 3 марта 2022 г. на базе лаборатории генетических технологий ЦНИЛ СибГМУ, г. Томск в рамках исследовательской программы "Развитие технологий геномного редактирования для решения инновационных задач биомедицины и диагностики".
Научно-практический семинар проводился с участием сотрудников компаний «БиоВитрум» и «NanoString technologies» и включал в себя два модуля:
28 февраля (лекции и семинары):
· Обзорная презентация по технологической платформе NanoString;
· Особенности анализаторов nCounter, GeoMx, CosMx и их применения;
· Примеры применения технологии GeoMx для клинических исследований в онкологии, исследование иммуноонкологических процессов и микроокружения опухоли;
· Практическое применение технологии CosMx.
- 1-3 марта (практикум)Выполнение всех этапов технологии Nanostring осуществлялось на контрольном образце миндалины, заключенном в парафин.
- 1 мартаПодготовка материалов и оборудования. Проведение депарафинизации, дегидратации и демаскировки образцов ткани. Нанесение РНК-зондов Cancer Transcriptome Atlas с последующей гибридизации overnight.
- 2 мартаИнкубация с флуоресцентно-меченными антителами. Загрузка стекол в прибор GeoMx, сканирование срезов и выбор регионов интереса (ROI) и перенос выбранных областей в планшет.
- 3 мартаПодготовка библиотек, анализ их качества с помощью станции электрофореза TapeStation. Анализ результатов. Подведение итогов.
